Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms