Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms