Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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