Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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AP3B2Q13367 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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AP3B2Q13367 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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AP3B2Q13367 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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AP3B2Q13367 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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AP3B2Q13367 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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AP3B2Q13367 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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