Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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