Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms