Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms