Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD54BQ9Y620 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD54BQ9Y620 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms