Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP16Q9Y5T5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms