Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms