Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF330Q9Y3S2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms