Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP3Q9Y2W1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms