Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms