Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALKQ9UM73 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ALKQ9UM73 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms