Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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TPCN1Q9ULQ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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TPCN1Q9ULQ1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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TPCN1Q9ULQ1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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TPCN1Q9ULQ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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TPCN1Q9ULQ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPCN1Q9ULQ1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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