Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB23Q9ULC3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms