Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms