Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms