Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA1Q9UIW2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms