Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms