Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms