Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM5BQ9UGL1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms