Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms