Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms