Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms