Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAE1Q9UBE0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms