Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms