Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms