Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms