Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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