Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT57Q9NWB7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms