Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms