Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms