Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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