Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
INCENPQ9NQS7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INCENPQ9NQS7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INCENPQ9NQS7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INCENPQ9NQS7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms