Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms