Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf50Q9HD87 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf50Q9HD87 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms