Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms