Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD1Q9H446 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD1Q9H446 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD1Q9H446 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms