Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms