Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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