Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM31Q9BZY9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms