Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTPBP4Q9BZE4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP4Q9BZE4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms