Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms