Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms