Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA7Q9BWT1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA7Q9BWT1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms