Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms