Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms