Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOXF2Q9BQY4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOXF2Q9BQY4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms