Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms